財政部臺北國稅局表示，營業人如有因進貨退出或折讓而收回營業稅額情事，應於發生當期之進項稅額中扣減已收回之營業稅額。
該局說明，依加值型及非加值型營業稅法第15條規定，營業人當期銷項稅額，扣減進項稅額後之餘額，為當期應納或溢付營業稅額。營業人因進貨退出或折讓而收回之營業稅額，應於發生進貨退出或折讓之當期進項稅額中扣減之。另依財政部76年2月27日台財稅第7630354號函規定，營業人購買貨物支付之進項稅額，因故未申報扣抵銷項稅額，嗣該筆交易發生進貨退出時，亦未申報扣減進項稅額，尚無漏稅情事，除查得該營業人有未依規定期限記帳者，應依稅捐稽徵法第45條規定處罰外，免予補稅及送罰。
該局舉例說明，甲公司111年5月20日向乙公司購買機器設備1台，已於111年5-6月營業稅申報取得該機器設備之進項金額新臺幣(下同)5,000,000元、稅額250,000元。嗣因機器偶發故障，甲乙雙方合意折讓，甲公司於111年10月25日出具金額900,000元、稅額45,000元銷貨退回、進貨退出或折讓證明單予乙公司，甲公司應於111年9-10月營業稅申報之進項稅額中扣減已收回之營業稅額45,000元；但如甲公司取得該機器設備之進項稅額及進貨折讓均未申報，並已依規定期限記帳，尚無漏稅及補稅處罰之疑慮。
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